Informatiker für Natural Language Processing (m/w/d)

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Berlin Institute of Health at Charité
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Veröffentlicht: 20.11.2023

Arbeitsort: 10115 Berlin

Die Mission des Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) ist die medizinische Translation: Erkenntnisse aus der biomedizinischen Forschung werden in neue Ansätze zur personalisierten Vorhersage, Prävention, Diagnostik und Therapie übertragen, umgekehrt führen Beobachtungen im klinischen Alltag zu neuen Forschungsideen. Ziel ist es, einen relevanten medizinischen Nutzen für Patient*innen und Bürger*innen zu erreichen. Das BIH wurde 2013 gegründet und wird zu 90 Prozent vom Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) und zu zehn Prozent vom Land Berlin gefördert. Seit 2021 ist das BIH als dritte Säule in die Charité integriert, als Translationsforschungsbereich der Charité.

Das BIH sucht ab sofort befristet bis zum – mit Aussicht auf Verlängerung – eine*n

(Medizin-)Informatiker*in für Natural Language Processing (w/m/d)

Für das Projekt GeMTeX, das im Rahmen der Medizininformatik-Initiative (MII) durchgeführt wird, suchen wir eine*n Informatiker*in in der Medizin. Im Fokus des Projekts steht die Entwicklung eines umfangreichen, standort­übergreifenden Korpus deutschsprachiger, klinischer Texte aus dem medizinischen Versorgungsbereich. Unser Hauptziel ist es, die Erforschung neuer Ansätze im Bereich des Natural Language Processing in der Medizin zu ermöglichen und zu erleichtern. Ihre Rolle ist integraler Bestandteil einer interdisziplinären Forschungs­umgebung, in der Sie eng mit anderen Fachleuten zusammen­arbeiten und dabei direkt in das nationale Umfeld der MII eingebunden sind. Das Projekt wird bundesweit vom Bundes­ministerium für Bildung und Forschung (BMBF) im Rahmen der MII gefördert. Die Stelle ist zunächst bis zum befristet. Es bestehen jedoch sehr gute Aussichten auf eine anschließende Fortführung des Projekts und eine Weiter­beschäftigung.

Ihr Aufgabengebiet:

  • Mitarbeit an einem interdisziplinären Forschungs­projekt zum Thema Sprachverarbeitung in der Medizin zusammen mit internen und externen Partnern
  • Entwicklung von Prozessen und Lösungen zum Aufbau eines deutschsprachigen Textkorpus in der Medizin
  • Design und Implementierung von Lösungen zur Anonymisierung und Annotation von klinischen Texten
  • Präsentation und Publikation von Projekt- und Forschungs­ergebnissen auf nationaler und internationaler Ebene
  • Betreuung von Studierenden (Bachelor-, Master-)Ebene
  • Ihr Profil:

  • Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium in Informatik, Medizin­informatik oder einer verwandten Fachrichtung
  • Kenntnisse in mindestens einem der folgenden Bereiche: Natural Language Processing, Forschungs­daten­management, Datenschutz
  • Erfahrung in der Entwicklung von Text-Annotationstools, Machine-Learning-Modellen oder Anonymisierungs­verfahren sind von Vorteil
  • Hohe Motivation und selbständige, strukturierte und verantwortungs­bewusste Arbeitsweise
  • Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift
  • Wir bieten:

  • Promotionsmöglichkeit in einem anspruchsvollen und abwechslungsreichen Arbeitsumfeld
  • Die Möglichkeit, wichtige Beiträge zur datengetriebenen und patienten­zentrierten Medizin zu leisten
  • Schnelle Übernahme von Verantwortung in einem stetig wachsenden Team
  • Sehr gute Fort- und Weiterbildungs­möglichkeiten
  • Eine befristete Voll- oder Teilzeitstelle (mind. 30,00 h/Woche) mit Option auf Verlängerung
  • Vergütung unter Berücksichtigung der persönlichen Voraussetzungen bis TVöD VKA-K E13
  • Zusätzliche im öffentlichen Dienst übliche Leistungen (u.a. Jahressonderzahlung, VBL)
  • 30 Urlaubstage pro Jahr (bei einer Fünf-Tage-Woche) sowie bis zu 24 Gleittage pro Jahr
  • Flexible Arbeitszeiten und Möglichkeit des mobilen Arbeitens zur besseren Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben
  • Sehr gut erreichbarer und attraktiver Arbeitsplatz am CCM, Charitéplatz 1, 10117 Berlin
  • Für fachliche Rückfragen zur Stellenausschreibung steht Ihnen Fabian Prasser () gerne zur Verfügung.

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